比如，某些体系定义对治也是清净，但另一些体系对治被划归以妄治妄，并非清净。

按照解深密的划分，清净另有表述方式：所谓诸佛菩萨的“清净所缘境界”，而遍计执与依他起都不清净。实际上要把在不清净遍计执上建立的依他起说为清净，有内在的逻辑困难。

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不过在遍及的基础之上，这个说法可商量。 圣者入世，自证清静，但圣者的业果犹存。这种业果，曾经是不清静的遍及熏修出来的。但这种业果，怕是不能阻碍圣者的清静吧。

另一例子，若有师兄正智显发，但是偶尔与尘劳起不如理做意，突然发现，又如理做意。这2个点里，就有遍及增长的部分。但并不会妨碍这位师兄的如理做意。 如对尘劳，不生烦恼，称为如理做意， 若对已生烦恼，如理做意，当转为菩提。

管见，并看来慈氏有过不少讨论，顺着兼兄的线索去学习下。